关于颜色，巴氏杀菌工艺对植物和动物组织中的色素（如叶绿素、花青素和类胡萝卜素）影响不大。在果汁中，多酚氧化酶是导致褐变和颜色变化的主要酶。但是，该酶在巴氏灭菌之前的除氧步骤中被脱活并除去了氧气。在牛奶中，巴氏消毒和生牛奶之间的色差与巴氏消毒之前发生的均质化步骤有关。在巴氏消毒之前，将牛奶均质化以乳化其脂肪和水溶性成分，玉米巴氏杀菌流水线 专卖，这使得巴氏消毒的牛奶与生牛奶相比具有更白的外观。对于蔬菜产品，颜解取决于温度条件和加热时间。如果果胶的加工温度过高，则由于果胶结构中的酶促和非酶促转化，巴氏杀菌可能会导致一些质地损失。但是，云南巴氏杀菌流水线 专卖，采用温和的热处理巴氏灭菌法，含乳饮料巴氏杀菌流水线 专卖，只要温度不超过80°C（176°F），就不会引起蔬菜质地变软的组织变软。
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牛奶从左侧开始，含乳饮料巴氏杀菌流水线 专卖，并进入含有功能性酶的管道，这些酶经过热处理后会变性并停止酶的功能。这有助于通过停止细胞功能来阻止病原体生长。冷却过程有助于阻止牛奶经历美拉德反应和焦糖化。巴氏灭菌过程还具有将细胞加热到因压力升高而的能力。食品可以通过两种方式进行巴氏消毒：包装在容器中之前或之后。将食物包装在玻璃杯中时，可使用热水降低热冲击的风险。塑料和金属也用于包装食品，由于热冲击的风险较低，因此通常用蒸汽或热水对它们进行巴氏消毒。
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巴氏杀菌对加工食品的感官特性也有很小但可测量的影响。在果汁中，巴氏杀菌可能会导致挥发性香气化合物损失。果汁产品在巴氏灭菌之前经过脱气过程，可能造成这种损失。脱气还可以xxx程度减少维生素C和胡萝卜素等营养物质的流失。为了防止由于挥发性化合物的损失而导致质量下降，可以利用挥发性回收物（尽管成本很高）来生产更的果汁产品。
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